53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2330 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 103 aa  199  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  89.11 
 
 		 104 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  64.58 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  51.55 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  52.87 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  55.56 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  51.69 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  46.39 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  47.31 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  47.31 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  47.31 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  52.27 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  52.22 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  44.68 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  42.86 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4012  gas vesicle protein GVPa  48.91 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  46.15 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  52.38 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  41.77 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  38.46 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  48.08 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  40 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  40 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  58.54 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  56.1 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  46.34 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  43.75 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  38.1 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  57.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  57.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  57.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  37.7 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  55 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  37.7 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  37.7 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  48.84 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.67 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  44.44 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  40.38 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  38.78 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  46.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  47.5 
 
 		 85 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  40 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  40 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  48.78 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  31.34 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  48.84 
 
 		 96 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>