213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2329 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  100 
 
 
311 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  94.21 
 
 
311 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  61.51 
 
 
418 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  44.9 
 
 
340 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  46 
 
 
334 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  44.37 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  45.42 
 
 
308 aa  252  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  46.04 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  40.14 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  42.86 
 
 
299 aa  240  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  39.39 
 
 
437 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  38.85 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  39.16 
 
 
316 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  38.78 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  40.71 
 
 
347 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  43.05 
 
 
373 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.21 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.35 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  23.44 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  23.61 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  25.89 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.25 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  22.71 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  23.11 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.11 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  23.15 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.36 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  22.55 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.37 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  22.17 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  23.72 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  23.04 
 
 
260 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  25.35 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  23.79 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  23.75 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  25.37 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.48 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  23 
 
 
277 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  24.52 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  23.83 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  24.52 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  21.62 
 
 
307 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  23.12 
 
 
282 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  23.12 
 
 
282 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  23.12 
 
 
282 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  23.35 
 
 
282 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  22.44 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  26.8 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  21.76 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.83 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  21.62 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  21.26 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  21.7 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.33 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  24.88 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  23.3 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.39 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  22.28 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  21.65 
 
 
272 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  21.65 
 
 
272 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  22.22 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.86 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  22.28 
 
 
271 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  22.62 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  22.62 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  22.62 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.57 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  21.89 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  25.13 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  20.3 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  21.81 
 
 
268 aa  59.3  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.93 
 
 
263 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.75 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.75 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  22.16 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.86 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  24.86 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.43 
 
 
855 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  22.93 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  20.48 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  23 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.93 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  22.4 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  19.81 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  21.95 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  20.45 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  29.65 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.47 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.08 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  22.47 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  21.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.2 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  21.8 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  23.7 
 
 
620 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  27.45 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  23.32 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  26.06 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  28.07 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  22.28 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>