40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2323 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 54 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  75.51 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  71.43 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.39 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.35 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.22 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  54.17 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.22 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.44 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  55.1 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  61.36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  57.78 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.52 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.52 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.52 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  56.52 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  60.47 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  56.52 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  56.25 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  57.78 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  55.56 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.1 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  58.14 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.1 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  58.14 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  58.14 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  58.14 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  50 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  53.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>