32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2322 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2322  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 62 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000661358  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.74 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.05 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  66.67 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  52.46 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.9 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  66.67 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  66.67 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  64.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  59.52 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.14 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.14 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  55 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  66.67 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  63.64 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  67.74 
 
 		 137 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  62.86 
 
 		 138 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  60.61 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  60.61 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  60.61 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  55 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  60.61 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  64.52 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  64.52 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  64.52 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>