More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2319 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  61.2 
 
 		 293 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  59.73 
 
 		 291 aa  353  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  54.36 
 
 		 308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  53.49 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  54.33 
 
 		 299 aa  321  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  52.96 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  50.67 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  42.4 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.88 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.29 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  42.66 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.87 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  47.92 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.1 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.04 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  37.74 
 
 		 314 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  42.31 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  43.46 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  38.64 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  43.08 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  37.99 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  37.99 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  41.29 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.21 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  44.31 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  37.32 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  43.89 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  44.09 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  36.96 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  37.58 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  36.62 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  42.05 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  46.51 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.47 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  34.53 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  41.34 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  36.01 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  37.46 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  41.06 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  43.6 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  38.51 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.32 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  42.92 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  40.55 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 		 304 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  44.65 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  38.13 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  40.84 
 
 		 366 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  42.05 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  41.3 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  35.88 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  35.88 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  36.64 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  36.14 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  35.31 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  40.93 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  40.55 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  42.33 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  36.21 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  40.71 
 
 		 342 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  42.35 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  35.88 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  40.24 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  40.24 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  35.62 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>