61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2292 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2292  ATPase  100 
 
 		 471 aa  954    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  41.45 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  42.8 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  41.34 
 
 		 460 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  37.93 
 
 		 477 aa  276  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  33.26 
 
 		 1213 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  36.71 
 
 		 566 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  34.35 
 
 		 1188 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  42.77 
 
 		 315 aa  213  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.11 
 
 		 1208 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.04 
 
 		 1193 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 1221 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  32.72 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1196 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  37.54 
 
 		 1190 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  34.92 
 
 		 1209 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.6 
 
 		 1188 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  27.25 
 
 		 513 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  36.45 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.8 
 
 		 1411 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  29.17 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 791 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 783 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.38 
 
 		 1247 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  40.7 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  34.62 
 
 		 111 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  29.76 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  24.8 
 
 		 797 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  34.67 
 
 		 1131 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  36.45 
 
 		 1438 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  24.03 
 
 		 930 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 1288 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 915 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  24.16 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  23.95 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  33.77 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 1050 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  24.8 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  24.38 
 
 		 956 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.95 
 
 		 1454 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  26.32 
 
 		 957 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  22.58 
 
 		 1071 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  25.95 
 
 		 1030 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  47.73 
 
 		 844 aa  46.6  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 1714 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  28.44 
 
 		 960 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 849 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  37.33 
 
 		 991 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  20.88 
 
 		 921 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0943  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  26.72 
 
 		 840 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  19.76 
 
 		 916 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  21.77 
 
 		 741 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1540  AAA ATPase  25.98 
 
 		 778 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000740195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 648 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  26 
 
 		 792 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  20.47 
 
 		 978 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  20.78 
 
 		 1010 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>