More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2178 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  58.5 
 
 
220 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  53.24 
 
 
200 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  53.24 
 
 
200 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  53.57 
 
 
217 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  50 
 
 
215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  51.72 
 
 
220 aa  215  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  52.15 
 
 
214 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  42.52 
 
 
190 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  44.27 
 
 
192 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  39.34 
 
 
197 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  44.27 
 
 
193 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  40.62 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  43.75 
 
 
190 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  40.31 
 
 
209 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  45 
 
 
189 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  41.27 
 
 
186 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  39.79 
 
 
181 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.14 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  37.5 
 
 
173 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  38.05 
 
 
194 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  42.05 
 
 
203 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.54 
 
 
173 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  33.2 
 
 
231 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.58 
 
 
187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  37.56 
 
 
178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  35.61 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  32.79 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  36.87 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  38.16 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  36.59 
 
 
194 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  41.99 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  40.11 
 
 
196 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  31.12 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  36.54 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  35.78 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.37 
 
 
171 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  36.84 
 
 
199 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  36.12 
 
 
219 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  35.09 
 
 
219 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  38.92 
 
 
197 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  35.68 
 
 
219 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  36.67 
 
 
200 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  34.5 
 
 
176 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.35 
 
 
225 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.06 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  38.34 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.18 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.18 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  36.67 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  34.92 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  36.92 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  34.6 
 
 
188 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  34.6 
 
 
188 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  34.83 
 
 
196 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.95 
 
 
174 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.85 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  34.54 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  34.92 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  34.92 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  34.92 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  33.81 
 
 
184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  36.98 
 
 
373 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  34.92 
 
 
187 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  34.98 
 
 
265 aa  117  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  34.26 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  36.04 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  34.39 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  37.75 
 
 
189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  33.86 
 
 
187 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  36.73 
 
 
221 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  35.98 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  31.58 
 
 
268 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  35.1 
 
 
220 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  36.76 
 
 
192 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  33.86 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  33.86 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  33.86 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  33.19 
 
 
289 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  37.23 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.64 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  37.29 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  37.02 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  36.04 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.51 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  34.87 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  34.87 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.55 
 
 
219 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  33.63 
 
 
260 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  34.1 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  34.04 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  35.6 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  37.76 
 
 
186 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  34.39 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  35.86 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  31.75 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  34.36 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  37.75 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  34.36 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  34.36 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>