30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2082 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2082  thymidylate synthase, flavin-dependent  100 
 
 		 458 aa  952    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.734062  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2917  thymidylate synthase complementing protein ThyX  71.05 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000386154  normal  0.0185293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  61.74 
 
 		 240 aa  206  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  57.89 
 
 		 251 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  57.89 
 
 		 241 aa  196  9e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  34.88 
 
 		 2684 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.41 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  30.23 
 
 		 879 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  35.38 
 
 		 602 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  29.89 
 
 		 945 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  33.93 
 
 		 261 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  31.82 
 
 		 593 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  38.1 
 
 		 284 aa  48.5  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  38.57 
 
 		 233 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  32.31 
 
 		 903 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  41.67 
 
 		 228 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  32.35 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  21.62 
 
 		 1098 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  38.1 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  31.31 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  33.9 
 
 		 2605 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.59 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  39.66 
 
 		 229 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  28.28 
 
 		 235 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  55.56 
 
 		 988 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  27.69 
 
 		 1272 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  45.95 
 
 		 585 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  25.32 
 
 		 874 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  36.11 
 
 		 233 aa  43.5  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.35 
 
 		 230 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>