More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2003 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
409 aa  845    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  72.25 
 
 
393 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  72.25 
 
 
393 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  70.54 
 
 
393 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2141  transposase, IS605 OrfB family  68.68 
 
 
363 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954173 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  43.4 
 
 
399 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  43.19 
 
 
398 aa  285  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  43.19 
 
 
398 aa  285  8e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  43.19 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  43.83 
 
 
383 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  42.86 
 
 
335 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  37.62 
 
 
442 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  38.08 
 
 
442 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  38.08 
 
 
442 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  37.23 
 
 
461 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  42.81 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  42.47 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  44.12 
 
 
292 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.84 
 
 
395 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  32.62 
 
 
372 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  32.62 
 
 
372 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  33.83 
 
 
402 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.25 
 
 
399 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  36.96 
 
 
440 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2681  transposase  45.85 
 
 
261 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 
435 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  34.95 
 
 
387 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  35.9 
 
 
390 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  33.87 
 
 
373 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  34.34 
 
 
393 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.05 
 
 
373 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  35.66 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  32.41 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  32.91 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  32.66 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  33.33 
 
 
402 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  33.33 
 
 
402 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  35.12 
 
 
368 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  33.08 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  32.92 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  34.96 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  35.38 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  32.64 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  34.03 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.5 
 
 
373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  32.41 
 
 
402 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  32.66 
 
 
402 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  32.16 
 
 
402 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  32.16 
 
 
402 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  37.19 
 
 
369 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  37.19 
 
 
369 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  37.19 
 
 
369 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  37.19 
 
 
369 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  37.19 
 
 
369 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.51 
 
 
373 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  33.24 
 
 
372 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.51 
 
 
373 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.51 
 
 
373 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4186  IS605 family transposase OrfB  63.45 
 
 
145 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.192154 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  32.97 
 
 
372 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 
410 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.67 
 
 
410 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 
383 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  32.58 
 
 
402 aa  193  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.66 
 
 
403 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  33.33 
 
 
372 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.17 
 
 
383 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.17 
 
 
383 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.17 
 
 
383 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.17 
 
 
383 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.51 
 
 
372 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 
399 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  34.54 
 
 
383 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  34.74 
 
 
399 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  33.16 
 
 
377 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  35.11 
 
 
383 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  35.28 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  35.28 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  33.43 
 
 
392 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  34.26 
 
 
383 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  33.78 
 
 
373 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.86 
 
 
405 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  33.61 
 
 
450 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  33.74 
 
 
420 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  34.84 
 
 
383 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  32.75 
 
 
400 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  33.7 
 
 
392 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0871  IS605 family transposase OrfB  35.48 
 
 
390 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000854897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  33.42 
 
 
377 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  34.47 
 
 
375 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  32.75 
 
 
411 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  34.54 
 
 
399 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  32.89 
 
 
393 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  35.16 
 
 
402 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  33.15 
 
 
390 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.47 
 
 
381 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.03 
 
 
424 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  33.33 
 
 
427 aa  186  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  34.79 
 
 
394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  35.52 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>