37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1951 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  57.64 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  54.68 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  54.68 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  55.8 
 
 
143 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  48.53 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  32.86 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  28.29 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  34.56 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  34.56 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  28.66 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  26.85 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  27.41 
 
 
147 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  28.95 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  28.67 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  28.67 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  28.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  27.63 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  28.38 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  24.32 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  28.19 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.37 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  25.68 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  28 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.37 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  27.33 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  38.27 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.99 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  31.03 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  28.21 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  35.56 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>