More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1924 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  100 
 
 		 551 aa  1108    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  44.08 
 
 		 478 aa  391  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  45.1 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  42.69 
 
 		 473 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  40.85 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  38.92 
 
 		 495 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  38.92 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  41.56 
 
 		 358 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 508 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  31.31 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  26.56 
 
 		 827 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  30.56 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  28.67 
 
 		 357 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  25.16 
 
 		 577 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.4 
 
 		 828 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 922 aa  98.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 830 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  23.21 
 
 		 948 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.9 
 
 		 910 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  24.01 
 
 		 828 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 1055 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  25.4 
 
 		 781 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.14 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  31.67 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 931 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.14 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.84 
 
 		 348 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.84 
 
 		 351 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.84 
 
 		 348 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  24.29 
 
 		 446 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  23.28 
 
 		 897 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 919 aa  90.5  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.46 
 
 		 920 aa  90.1  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  31.25 
 
 		 415 aa  90.1  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 869 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 921 aa  89.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.12 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  24.1 
 
 		 919 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 828 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 915 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  24.32 
 
 		 912 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  24.01 
 
 		 837 aa  87  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  24.01 
 
 		 837 aa  87  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  29.95 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  26.14 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 834 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.07 
 
 		 703 aa  83.6  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.97 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.72 
 
 		 386 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.34 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.34 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 837 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.34 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.34 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.34 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  22.82 
 
 		 920 aa  81.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  27.15 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.5 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 869 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 833 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.8 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  22.07 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  25.47 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  28.96 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  25.39 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  23.71 
 
 		 952 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  23.73 
 
 		 846 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 803 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  29.05 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  25.86 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.23 
 
 		 700 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 185 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 386 aa  73.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  21.52 
 
 		 347 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.69 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 977 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.66 
 
 		 869 aa  72  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  28.25 
 
 		 391 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>