41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1859 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  100 
 
 
140 aa  286  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  74.07 
 
 
137 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  80.33 
 
 
124 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  77.24 
 
 
137 aa  199  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  80.34 
 
 
121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  79.82 
 
 
126 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  79.82 
 
 
126 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  58.96 
 
 
134 aa  154  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  52.85 
 
 
125 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 
133 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 
133 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  49.61 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  54.39 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  54.39 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  54.39 
 
 
144 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  50.85 
 
 
134 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  56.52 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  55.56 
 
 
123 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  56.76 
 
 
118 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  56.76 
 
 
118 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  55.86 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  54.95 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  53.15 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  53.15 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  51.26 
 
 
123 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  56.36 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  51.82 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  53.23 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  49.24 
 
 
128 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  53.28 
 
 
123 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  48.76 
 
 
122 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  42.99 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  44.86 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  43.93 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  43.93 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  45.79 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  43.93 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  44.86 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  44.95 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  38.14 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  40.31 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>