42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1835 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  59.77 
 
 		 2194 aa  1046    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  100 
 
 		 2062 aa  4048    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  54.12 
 
 		 1289 aa  629  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  53.35 
 
 		 995 aa  315  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.44 
 
 		 1143 aa  145  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  35.5 
 
 		 800 aa  135  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  36.67 
 
 		 2632 aa  123  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  33.04 
 
 		 1027 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  35.71 
 
 		 2334 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  36.56 
 
 		 715 aa  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  30.18 
 
 		 3193 aa  111  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  33.33 
 
 		 863 aa  107  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  31.84 
 
 		 390 aa  103  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  49.21 
 
 		 167 aa  102  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  20.21 
 
 		 4689 aa  101  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  34.8 
 
 		 417 aa  99.4  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  26.8 
 
 		 1594 aa  92.8  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  30.16 
 
 		 1156 aa  92  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  31.89 
 
 		 599 aa  90.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  32.27 
 
 		 596 aa  85.9  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  30.04 
 
 		 602 aa  85.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  29.44 
 
 		 630 aa  78.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  28.68 
 
 		 685 aa  78.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  26.52 
 
 		 689 aa  74.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  27.16 
 
 		 528 aa  71.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  37.93 
 
 		 827 aa  71.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  27.1 
 
 		 565 aa  67.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4908  hypothetical protein  26.58 
 
 		 535 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.36 
 
 		 891 aa  61.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  26.13 
 
 		 1063 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4897  hypothetical protein  25.99 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  24.76 
 
 		 539 aa  57.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  25.5 
 
 		 407 aa  56.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  26.19 
 
 		 465 aa  54.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0783  peptidase-like  24.89 
 
 		 451 aa  52.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.66 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  31.63 
 
 		 619 aa  49.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01964  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  48.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  17.27 
 
 		 2268 aa  47.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  24.64 
 
 		 553 aa  47.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  26.29 
 
 		 560 aa  47.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.63 
 
 		 1225 aa  45.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>