173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1773 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62.12 
 
 		 1012 aa  1014    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  84.25 
 
 		 1118 aa  1425    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  84.27 
 
 		 1113 aa  1408    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  79.37 
 
 		 1340 aa  1341    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 889 aa  1757    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  68.29 
 
 		 2194 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.02 
 
 		 1009 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  80.02 
 
 		 1222 aa  1341    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  79.8 
 
 		 1225 aa  1341    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.66 
 
 		 891 aa  575  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  54.11 
 
 		 1019 aa  323  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  43.31 
 
 		 1838 aa  248  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  42.59 
 
 		 1037 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  40.7 
 
 		 2807 aa  224  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.59 
 
 		 1800 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.34 
 
 		 1557 aa  205  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  39.18 
 
 		 828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  40.88 
 
 		 412 aa  200  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  38.82 
 
 		 872 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.35 
 
 		 928 aa  194  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  39.27 
 
 		 386 aa  189  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  37.37 
 
 		 644 aa  181  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  31.27 
 
 		 4379 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  34.29 
 
 		 554 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.37 
 
 		 1269 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.37 
 
 		 1269 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  39.44 
 
 		 974 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  39.33 
 
 		 662 aa  167  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.03 
 
 		 1661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.63 
 
 		 2305 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.3 
 
 		 2310 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  36.78 
 
 		 1490 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  38.37 
 
 		 1126 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1289 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  34.31 
 
 		 1275 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  37.86 
 
 		 604 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.91 
 
 		 768 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  30.49 
 
 		 1029 aa  149  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.75 
 
 		 1029 aa  148  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37 
 
 		 813 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.63 
 
 		 616 aa  140  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  31.36 
 
 		 5899 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.29 
 
 		 1415 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  35.47 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  32.45 
 
 		 469 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  31.16 
 
 		 494 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.58 
 
 		 3396 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.51 
 
 		 1180 aa  99  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  33.81 
 
 		 3197 aa  97.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.66 
 
 		 685 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  31.93 
 
 		 485 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.09 
 
 		 3197 aa  96.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.42 
 
 		 663 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  36.84 
 
 		 5444 aa  90.9  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  38.33 
 
 		 7149 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.04 
 
 		 1124 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1058 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  29.05 
 
 		 4013 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  34.36 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.28 
 
 		 3168 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.29 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  47.12 
 
 		 161 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  26.92 
 
 		 2127 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  35.51 
 
 		 894 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  32.93 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  35.51 
 
 		 894 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.54 
 
 		 8871 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.89 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.59 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  32.82 
 
 		 837 aa  68.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.78 
 
 		 547 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  32.76 
 
 		 2796 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.09 
 
 		 1091 aa  64.7  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  25.99 
 
 		 1031 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.98 
 
 		 510 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.71 
 
 		 16311 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  32.48 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  25 
 
 		 917 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  26.86 
 
 		 2251 aa  62.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.69 
 
 		 4848 aa  62.4  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  28.52 
 
 		 1527 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.7 
 
 		 11716 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  27.3 
 
 		 2042 aa  61.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.08 
 
 		 5098 aa  61.2  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 		 2281 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  30.16 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  28.95 
 
 		 1053 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 		 1092 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  38.14 
 
 		 934 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.45 
 
 		 1021 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1328 aa  57.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  21.4 
 
 		 615 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1210 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1638 aa  55.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1806 aa  55.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1350 aa  55.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.07 
 
 		 365 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.85 
 
 		 404 aa  55.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.25 
 
 		 1192 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>