210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1772 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62 
 
 
1012 aa  1018    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  83.07 
 
 
1118 aa  1593    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  81.43 
 
 
1113 aa  1545    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 
1340 aa  2666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  79.37 
 
 
889 aa  1340    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  68.41 
 
 
2194 aa  1053    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.25 
 
 
1009 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  85.87 
 
 
1222 aa  1857    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  82.23 
 
 
1225 aa  1760    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.56 
 
 
891 aa  589  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.64 
 
 
1800 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  57.51 
 
 
1019 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.03 
 
 
1269 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.73 
 
 
1269 aa  320  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.19 
 
 
1661 aa  298  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  28.76 
 
 
1029 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  45.95 
 
 
1838 aa  278  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.37 
 
 
1029 aa  277  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  41.14 
 
 
2807 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  40.37 
 
 
1037 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.98 
 
 
2310 aa  237  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  42.05 
 
 
828 aa  229  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.55 
 
 
5899 aa  229  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.25 
 
 
2305 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  35.86 
 
 
1557 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  43.86 
 
 
386 aa  210  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  42.95 
 
 
412 aa  205  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  40.19 
 
 
872 aa  198  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.89 
 
 
928 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  39.18 
 
 
974 aa  194  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  42.52 
 
 
1126 aa  185  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.33 
 
 
3396 aa  183  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  40.64 
 
 
1490 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  34.58 
 
 
554 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  38.24 
 
 
1275 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  37.78 
 
 
644 aa  176  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.07 
 
 
813 aa  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  41.47 
 
 
662 aa  164  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  40.11 
 
 
604 aa  160  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.45 
 
 
768 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.62 
 
 
4379 aa  160  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.96 
 
 
1289 aa  158  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.16 
 
 
4013 aa  142  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.03 
 
 
616 aa  136  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.53 
 
 
1415 aa  134  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  24.47 
 
 
2127 aa  125  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  32.12 
 
 
472 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  33.6 
 
 
469 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.24 
 
 
1021 aa  111  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  24.75 
 
 
2042 aa  109  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  33.81 
 
 
494 aa  108  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.14 
 
 
5098 aa  103  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  31.01 
 
 
485 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.49 
 
 
1180 aa  102  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.27 
 
 
3197 aa  99.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  33.63 
 
 
5444 aa  99  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  34.99 
 
 
1124 aa  98.6  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.99 
 
 
3168 aa  97.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  37.34 
 
 
663 aa  97.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.84 
 
 
8871 aa  94.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  33.53 
 
 
657 aa  90.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  36.07 
 
 
7149 aa  89.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  33.45 
 
 
3197 aa  89  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  48.67 
 
 
161 aa  87  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.62 
 
 
647 aa  85.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  32.6 
 
 
685 aa  84.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  29.27 
 
 
1058 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 
894 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  38.34 
 
 
837 aa  80.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.1 
 
 
4848 aa  80.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.7 
 
 
11716 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  37.61 
 
 
894 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.43 
 
 
255 aa  77.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.23 
 
 
2796 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.84 
 
 
547 aa  72.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  33.13 
 
 
427 aa  72  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  37.96 
 
 
2334 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.62 
 
 
959 aa  71.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  27.03 
 
 
1022 aa  70.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  31.93 
 
 
1638 aa  70.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  33.51 
 
 
510 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  31.37 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  36.79 
 
 
2632 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27 
 
 
437 aa  67.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  21.19 
 
 
615 aa  66.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  24.78 
 
 
1031 aa  65.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.05 
 
 
1527 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.18 
 
 
1091 aa  65.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  33.94 
 
 
863 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  32.74 
 
 
1053 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30 
 
 
600 aa  63.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
1127 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  45.95 
 
 
934 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.17 
 
 
5962 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  30.88 
 
 
562 aa  62  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  28.11 
 
 
917 aa  62  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 
5171 aa  61.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.71 
 
 
16311 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  29.02 
 
 
2251 aa  60.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  29.03 
 
 
523 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>