76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1667 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  100 
 
 		 344 aa  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  77.71 
 
 		 359 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  76.47 
 
 		 342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  76.47 
 
 		 342 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  56.21 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  54.94 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  53.03 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  48.41 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  48.41 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  48.12 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  48.28 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  46.22 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  47.83 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  45.85 
 
 		 352 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  46.55 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  46.55 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  47.38 
 
 		 522 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  46.38 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  45.82 
 
 		 352 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  45.82 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  45.11 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  45.11 
 
 		 349 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  48.09 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  52.54 
 
 		 459 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  51.09 
 
 		 460 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  51.09 
 
 		 460 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  43.68 
 
 		 355 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  49.64 
 
 		 461 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  49.28 
 
 		 459 aa  279  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  40.28 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  48.31 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  40.28 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  42.05 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  52.9 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  43.1 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  43.1 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  40.22 
 
 		 365 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  43.99 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  43.99 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  41.55 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  41.55 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  47.81 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  50.72 
 
 		 459 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.65 
 
 		 464 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  46.47 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  39.77 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  39.77 
 
 		 370 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  42.57 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  48.21 
 
 		 462 aa  255  8e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  39.49 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  48.91 
 
 		 462 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.95 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.95 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  47.67 
 
 		 460 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.95 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.95 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.95 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.95 
 
 		 460 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.15 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.15 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.34 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  23.4 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.35 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  27.84 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  26.91 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25.37 
 
 		 509 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  27.04 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.37 
 
 		 508 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.74 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  22.78 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.74 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  22.78 
 
 		 519 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.72 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.72 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  23.19 
 
 		 519 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.1 
 
 		 518 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>