24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1630 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  100 
 
 		 143 aa  291  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  88.11 
 
 		 1391 aa  261  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  86.01 
 
 		 1570 aa  255  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  84.62 
 
 		 1349 aa  253  7e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  47.86 
 
 		 608 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  45.71 
 
 		 595 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  45.32 
 
 		 568 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  45.32 
 
 		 568 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  47.97 
 
 		 588 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  47.15 
 
 		 585 aa  114  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  43.97 
 
 		 595 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.99 
 
 		 580 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  38.71 
 
 		 584 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.01 
 
 		 584 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.01 
 
 		 639 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  39.31 
 
 		 692 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  39.5 
 
 		 585 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  37.6 
 
 		 587 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.33 
 
 		 533 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  33.7 
 
 		 531 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.93 
 
 		 576 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.08 
 
 		 553 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  29.45 
 
 		 587 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  47.73 
 
 		 555 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>