More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1565 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 320 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  55.06 
 
 		 320 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  56.83 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  57.32 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  57.32 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  55.59 
 
 		 317 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.46 
 
 		 325 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  51.92 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  47.81 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  43.26 
 
 		 326 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  42.09 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  34.27 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  37.72 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  36.88 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  28.21 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  27.04 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  27.56 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  28.25 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.19 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.57 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.43 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  34.86 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.9 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  33.18 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.59 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.94 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.92 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.79 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.03 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.52 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.5 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.29 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  34.07 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  32.22 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.7 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.97 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.39 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  31.53 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.87 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 517 aa  93.2  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  30.85 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  30.85 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  32.16 
 
 		 382 aa  92.8  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.42 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  31.48 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.3 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  29.02 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.78 
 
 		 373 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  28.25 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  29.07 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.67 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  27.16 
 
 		 559 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.1 
 
 		 391 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.61 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.87 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.72 
 
 		 562 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.85 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  29.28 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.36 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  29.78 
 
 		 388 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  31 
 
 		 388 aa  89  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.11 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  31.53 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.7 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.16 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  31.41 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  30.67 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.57 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.72 
 
 		 570 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  27.31 
 
 		 652 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.37 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  30.37 
 
 		 327 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.5 
 
 		 421 aa  86.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.79 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.89 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.37 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.73 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  29.18 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.48 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.22 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.37 
 
 		 648 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.69 
 
 		 695 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.87 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.28 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.28 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  30.67 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  35.12 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.1 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.84 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.71 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>