More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1470 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3128  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.85 
 
 
680 aa  838    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.97 
 
 
645 aa  853    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  64.45 
 
 
650 aa  887    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
696 aa  659    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472328  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.36 
 
 
688 aa  664    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  49.49 
 
 
685 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.59 
 
 
658 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.826724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.23 
 
 
664 aa  815    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.52 
 
 
669 aa  878    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2992  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.85 
 
 
680 aa  837    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1470  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
716 aa  1464    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246834 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  48.35 
 
 
689 aa  635  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  47.67 
 
 
686 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  47.91 
 
 
688 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  47.36 
 
 
688 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  47.33 
 
 
689 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  45.89 
 
 
689 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  46.28 
 
 
689 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
444 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
589 aa  187  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  26.12 
 
 
762 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.54 
 
 
598 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
758 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
597 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
590 aa  170  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
763 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 
599 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
604 aa  167  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
589 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
604 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
581 aa  164  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
577 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
590 aa  161  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
589 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
597 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
785 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
592 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
612 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.36 
 
 
599 aa  156  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
2783 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
577 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
418 aa  154  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
596 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
754 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
695 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
625 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
633 aa  150  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 
752 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 
611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  23.19 
 
 
613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
584 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
880 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  25.65 
 
 
591 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
588 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
2161 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
595 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
884 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
600 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
593 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
623 aa  146  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
725 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
2153 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
566 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
593 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  23.19 
 
 
613 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
718 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  23.19 
 
 
613 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  23.19 
 
 
613 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  35.98 
 
 
571 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  23.19 
 
 
613 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
581 aa  144  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  23.19 
 
 
613 aa  143  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  23.01 
 
 
613 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  23.19 
 
 
613 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  23.19 
 
 
613 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
582 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  35.61 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  28.64 
 
 
346 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
590 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
584 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  32.96 
 
 
617 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
430 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
412 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
932 aa  140  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
307 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
412 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  25.42 
 
 
581 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>