24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1468 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  213  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0332  hypothetical protein  69.81 
 
 
107 aa  156  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2894  hypothetical protein  68.87 
 
 
107 aa  154  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0388565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  66.98 
 
 
107 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  66.98 
 
 
107 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  67.92 
 
 
108 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3859  hypothetical protein  62.62 
 
 
107 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2355  hypothetical protein  54.37 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1523  hypothetical protein  48.31 
 
 
108 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0875  hypothetical protein  47.13 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.223347  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  25.53 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2587  hypothetical protein  24.07 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  28.71 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1152  hypothetical protein  27.91 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  22.83 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  21.74 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  20 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  23.23 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  26.04 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  26.67 
 
 
309 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  19.05 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  23.93 
 
 
261 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  23.93 
 
 
261 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  21.25 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>