More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1362 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  100 
 
 		 472 aa  974    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  52.03 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  49.02 
 
 		 447 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.29 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  59 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.26 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  38.98 
 
 		 870 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  56.02 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  38.32 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  56.17 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  55.42 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  57.89 
 
 		 429 aa  283  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  52.87 
 
 		 450 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  52.7 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  52.67 
 
 		 435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.68 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  52.72 
 
 		 711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 		 416 aa  270  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  36.83 
 
 		 472 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  38.22 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  37.79 
 
 		 472 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  50.41 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.03 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.03 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 469 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  49.6 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  52.02 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  34.71 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  47.83 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  54.3 
 
 		 816 aa  252  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  49.37 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  47.77 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.06 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  47.18 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  46.69 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  49.58 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  46.03 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  46.21 
 
 		 498 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  49.37 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  51.57 
 
 		 407 aa  242  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  47.41 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  48.95 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  49.37 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  50.21 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  48.32 
 
 		 436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 415 aa  240  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.24 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  43.8 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  45.61 
 
 		 254 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.8 
 
 		 418 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 393 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 393 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.54 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  46 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  39.61 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  46.81 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  48.1 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  46.22 
 
 		 649 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  48.54 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  47.73 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  40.07 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  43.6 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  49.01 
 
 		 428 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  52.41 
 
 		 369 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  41.76 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  50 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  48.24 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 439 aa  226  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  46.6 
 
 		 422 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  48.06 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  40.58 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  45.34 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  45.12 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  50.25 
 
 		 427 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  42.37 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  44.78 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  47.32 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  52.38 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  42.06 
 
 		 412 aa  223  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  50.79 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  45.67 
 
 		 254 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  43.83 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  47.26 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  51.85 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  41.6 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  45.98 
 
 		 266 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  42.4 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  51.91 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>