39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1337 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  100 
 
 
559 aa  1143    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  51.49 
 
 
562 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  51.93 
 
 
569 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  51.67 
 
 
562 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  48.64 
 
 
525 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  45.12 
 
 
544 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  31.32 
 
 
835 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  33.73 
 
 
823 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  31.44 
 
 
806 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
1958 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
1203 aa  84.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.07 
 
 
943 aa  81.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.81 
 
 
1238 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  27.52 
 
 
1689 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  23.8 
 
 
697 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  31.76 
 
 
782 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  26.01 
 
 
694 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  26.01 
 
 
689 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.99 
 
 
1914 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
1714 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
1313 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  28.4 
 
 
1073 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  29.8 
 
 
496 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
1101 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  21.49 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
813 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  27.71 
 
 
489 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  20.17 
 
 
699 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.86 
 
 
1611 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
1063 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  25 
 
 
689 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  28.75 
 
 
440 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  26.35 
 
 
1020 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  24.56 
 
 
1921 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  23.7 
 
 
550 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0053  hypothetical protein  25.43 
 
 
750 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0689055  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  33.98 
 
 
682 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  25.73 
 
 
848 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  40.38 
 
 
1736 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0314468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>