121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1234 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 639 aa  1302    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  49.39 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  45.79 
 
 		 574 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  44.95 
 
 		 561 aa  475  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  43.25 
 
 		 641 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  45.37 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  43.78 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  45.76 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  42.17 
 
 		 551 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  38.97 
 
 		 666 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  38.97 
 
 		 666 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  42.13 
 
 		 581 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  42.25 
 
 		 529 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  44.07 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  43.12 
 
 		 604 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  40.4 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  40.28 
 
 		 572 aa  362  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  41.48 
 
 		 542 aa  357  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  38.96 
 
 		 622 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  35 
 
 		 658 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  41.36 
 
 		 539 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  35.81 
 
 		 591 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  35.35 
 
 		 593 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  38.27 
 
 		 624 aa  329  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  38.55 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.75 
 
 		 571 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  34.54 
 
 		 600 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  36.57 
 
 		 586 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  36.57 
 
 		 586 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  34.4 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  34.4 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  37.61 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  32.25 
 
 		 589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  39.4 
 
 		 645 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  37.27 
 
 		 632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  34.24 
 
 		 508 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  37 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  33.85 
 
 		 643 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  34.87 
 
 		 606 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  37.27 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.76 
 
 		 513 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  33.27 
 
 		 543 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  34.5 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  51.02 
 
 		 531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  33.82 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  34.23 
 
 		 561 aa  223  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  33.62 
 
 		 555 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  34.35 
 
 		 629 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  33.88 
 
 		 524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  32.66 
 
 		 500 aa  213  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  57.22 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  48.71 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  41.3 
 
 		 518 aa  197  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  31.26 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  45.23 
 
 		 531 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  46.09 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  30.54 
 
 		 527 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  38.82 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  56.13 
 
 		 188 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  29.62 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  28.83 
 
 		 515 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  35.48 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  25.95 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  53.09 
 
 		 261 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  38.64 
 
 		 262 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  38.64 
 
 		 262 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  30.11 
 
 		 449 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  31.71 
 
 		 440 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  26.01 
 
 		 437 aa  90.5  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  25.17 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  24.46 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  24.12 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  33.13 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  33.14 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.06 
 
 		 384 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.1 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  40.71 
 
 		 946 aa  70.5  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  29.48 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.74 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36.19 
 
 		 932 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 673 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.96 
 
 		 416 aa  62  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  29.53 
 
 		 784 aa  61.6  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  38.83 
 
 		 919 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  32.11 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  26.44 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.51 
 
 		 1036 aa  54.7  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  35.65 
 
 		 424 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  31.43 
 
 		 332 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  32 
 
 		 333 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  38.33 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  26.01 
 
 		 431 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.82 
 
 		 413 aa  50.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  31.62 
 
 		 330 aa  50.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  28.97 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  42.86 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  33.83 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>