20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1168 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1168  Thf1-like protein  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.73706  decreased coverage  0.000261237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2617  photosystem II biogenesis protein Psp29  60.45 
 
 
235 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4577  Thf1-like protein  56.36 
 
 
233 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1143  Thf1-like protein  51.34 
 
 
235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1173  Thf1-like protein  51.34 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5166  Thf1-like protein  48.33 
 
 
236 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5175  Thf1-like protein  51.33 
 
 
226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1555  Thf1-like protein  43.44 
 
 
280 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0657894  normal  0.198301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15471  Thf1-like protein  33.33 
 
 
250 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1058  Thf1-like protein  32.77 
 
 
215 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0565154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1441  Thf1-like protein  29.44 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.525764  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6426  predicted protein  31.63 
 
 
203 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313181  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0291  Thf1-like protein  29.15 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.550291  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09631  Thf1-like protein  29.15 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0866788 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08431  Thf1-like protein  23.89 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.171667  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08021  Thf1-like protein  26.03 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08011  Thf1-like protein  23.65 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08431  Thf1-like protein  25.23 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37959  predicted protein  25.62 
 
 
311 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0749  Thf1-like protein  24.65 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>