210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1166 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
343 aa  715    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  75.52 
 
 
348 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  74.64 
 
 
347 aa  548  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  75.91 
 
 
345 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  75.6 
 
 
346 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  75.6 
 
 
346 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  75.84 
 
 
344 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  70.94 
 
 
347 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  73.57 
 
 
317 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  67.75 
 
 
362 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  67.08 
 
 
362 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  63.28 
 
 
348 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  62.99 
 
 
348 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  64.31 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  66.77 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  59.94 
 
 
342 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  59.63 
 
 
342 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  60.31 
 
 
342 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  59.57 
 
 
342 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  57.76 
 
 
309 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  55.72 
 
 
304 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  57.01 
 
 
304 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  53.41 
 
 
323 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  55.59 
 
 
303 aa  362  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  54.98 
 
 
302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 
302 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 
302 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  54.24 
 
 
302 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  54.68 
 
 
302 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  54.68 
 
 
302 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  55.45 
 
 
310 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  55.31 
 
 
302 aa  359  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  54.85 
 
 
306 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  55.17 
 
 
302 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  55.18 
 
 
303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  55.42 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  53.92 
 
 
317 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 
305 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  55.52 
 
 
296 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  55.52 
 
 
296 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  52.73 
 
 
311 aa  352  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  55.14 
 
 
299 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  55.14 
 
 
299 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  53.31 
 
 
306 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  53.07 
 
 
310 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  55.14 
 
 
299 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  55.14 
 
 
299 aa  348  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  54.83 
 
 
299 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  54.83 
 
 
299 aa  348  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  54.83 
 
 
299 aa  348  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
299 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  52.32 
 
 
302 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
299 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
299 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  54.37 
 
 
299 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 
299 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  54.91 
 
 
305 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 
299 aa  346  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
333 aa  345  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  53.61 
 
 
309 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  53.61 
 
 
309 aa  345  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  53.61 
 
 
309 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  53.61 
 
 
312 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  53.89 
 
 
299 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  53.58 
 
 
299 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  53.37 
 
 
305 aa  341  9e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  52.76 
 
 
305 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  52.63 
 
 
307 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  52.28 
 
 
307 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 
306 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  55.45 
 
 
299 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  52.92 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 
298 aa  338  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  51.38 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  53.4 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 
310 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  51.2 
 
 
312 aa  336  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  53.09 
 
 
299 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  51.08 
 
 
304 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  52.04 
 
 
310 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  53.59 
 
 
304 aa  332  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  49.39 
 
 
305 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 
298 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  51.52 
 
 
323 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  49.39 
 
 
305 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  50.3 
 
 
331 aa  329  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  51.71 
 
 
305 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  51.81 
 
 
303 aa  328  7e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  50.77 
 
 
304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  49.1 
 
 
309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 
302 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  48.49 
 
 
311 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  50.77 
 
 
326 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  51.38 
 
 
323 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  51.38 
 
 
323 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  51.38 
 
 
307 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  50.77 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  51.68 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 
304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  49.54 
 
 
302 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>