More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1079 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  100 
 
 
296 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  72.11 
 
 
295 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  73.7 
 
 
291 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  70.47 
 
 
298 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  70.81 
 
 
298 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  69.8 
 
 
298 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  75.09 
 
 
294 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  64.79 
 
 
286 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  63.43 
 
 
277 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  60.31 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  60.69 
 
 
274 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  66.17 
 
 
284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  59.57 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  59.92 
 
 
274 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  59.92 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  62.68 
 
 
284 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  58.58 
 
 
284 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  59.32 
 
 
284 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
257 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  31.1 
 
 
261 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
260 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 
259 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 
241 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.15 
 
 
256 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.06 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 
255 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.74 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.49 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.34 
 
 
253 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  31.43 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  29.36 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
293 aa  89  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.72 
 
 
253 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.84 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.63 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.05 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.83 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  31.58 
 
 
241 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.05 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.65 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.86 
 
 
241 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.77 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.23 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  32.04 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.34 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  31.16 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.65 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.5 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.48 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.36 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.7 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  28.46 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.86 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>