More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0969 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  100 
 
 
243 aa  504  1e-142  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  72.34 
 
 
239 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  72.34 
 
 
239 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  70.78 
 
 
235 aa  360  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  68.72 
 
 
235 aa  350  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  76.67 
 
 
235 aa  342  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  71.49 
 
 
247 aa  342  3e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  79.89 
 
 
213 aa  331  7e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
216 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 
218 aa  282  3e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 
214 aa  282  4e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 
214 aa  282  4e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  60.1 
 
 
212 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  59.24 
 
 
270 aa  243  2e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  61.67 
 
 
219 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  61.88 
 
 
223 aa  239  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  59.67 
 
 
186 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  62.36 
 
 
223 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  51.75 
 
 
219 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  59.12 
 
 
186 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  61.85 
 
 
189 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  59.67 
 
 
186 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  61.93 
 
 
218 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 
226 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  56.91 
 
 
435 aa  236  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 
181 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  60 
 
 
216 aa  234  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  61.85 
 
 
186 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 
181 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 
181 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
186 aa  234  1e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 
186 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 
181 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 
187 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  60.12 
 
 
181 aa  231  8e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  60.12 
 
 
187 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 
181 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 
186 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
202 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  50.22 
 
 
329 aa  229  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  56.59 
 
 
185 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  56.42 
 
 
186 aa  229  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 
198 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  6.26036e-06 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  56.68 
 
 
201 aa  228  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 
213 aa  228  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  56.84 
 
 
199 aa  228  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 
184 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  57.54 
 
 
179 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 
181 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  59.3 
 
 
181 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 
190 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
190 aa  225  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  55.98 
 
 
200 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
190 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  54.29 
 
 
188 aa  222  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  54.29 
 
 
184 aa  222  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 
195 aa  222  5e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  55.85 
 
 
193 aa  222  5e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  56.89 
 
 
185 aa  221  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 
226 aa  218  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 
220 aa  218  9e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 
199 aa  217  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  63.03 
 
 
195 aa  216  3e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 
225 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
179 aa  215  6e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  55.75 
 
 
182 aa  214  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 
190 aa  214  7e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 
224 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
213 aa  213  1e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
213 aa  212  4e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 
180 aa  212  5e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  59.3 
 
 
181 aa  212  5e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 
190 aa  212  5e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 
179 aa  211  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  54.97 
 
 
184 aa  211  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 
257 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  58.72 
 
 
181 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  58.72 
 
 
190 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  57.23 
 
 
210 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  54.02 
 
 
181 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  55.08 
 
 
217 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 
179 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 
206 aa  208  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 
193 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 
193 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  45.65 
 
 
241 aa  207  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  53.04 
 
 
200 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
207 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  49.76 
 
 
210 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  53.85 
 
 
185 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 
190 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  50.51 
 
 
227 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  48.95 
 
 
194 aa  202  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  51.05 
 
 
202 aa  201  1e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
195 aa  201  1e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
194 aa  200  2e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  53.04 
 
 
202 aa  200  2e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  52.98 
 
 
201 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  9.98174e-12  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
188 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  50.27 
 
 
203 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>