88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0937 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  100 
 
 		 566 aa  1150    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  44.16 
 
 		 1188 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  36.33 
 
 		 1213 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  37.81 
 
 		 1208 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  33.45 
 
 		 1193 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 1221 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 		 1190 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  36.14 
 
 		 1209 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1196 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  37.06 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  33.64 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  32.07 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  34.86 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  29.15 
 
 		 477 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  28.73 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.56 
 
 		 1188 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  31.02 
 
 		 492 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 462 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 		 1411 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  28.06 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  33.02 
 
 		 315 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  28.34 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.06 
 
 		 1247 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 783 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  49.38 
 
 		 303 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  23.19 
 
 		 1017 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  28.74 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  32.91 
 
 		 111 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  28.83 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  22.36 
 
 		 601 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1088 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  23.35 
 
 		 689 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  26.42 
 
 		 989 aa  54.3  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 648 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 990 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  22.58 
 
 		 957 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22.67 
 
 		 999 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  24.57 
 
 		 1010 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.66 
 
 		 792 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  38.1 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  26.44 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  24.69 
 
 		 1014 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  22.89 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  22.46 
 
 		 591 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  24.32 
 
 		 982 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  23.87 
 
 		 621 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  22.05 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  22.05 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  25.12 
 
 		 958 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  24.35 
 
 		 1030 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  25.2 
 
 		 915 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1540  AAA ATPase  27.46 
 
 		 778 aa  48.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000740195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  32.94 
 
 		 638 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  22.77 
 
 		 591 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 799 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.67 
 
 		 992 aa  47.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1714 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 901 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  24.56 
 
 		 1008 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.45 
 
 		 921 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  25.68 
 
 		 961 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 1128 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 1071 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  25.69 
 
 		 975 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  23.39 
 
 		 1092 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 335 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  28.45 
 
 		 1326 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  22.17 
 
 		 1003 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  26.32 
 
 		 960 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 950 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  22.93 
 
 		 966 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  24.71 
 
 		 993 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.56 
 
 		 1288 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  21.61 
 
 		 1125 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  26.89 
 
 		 856 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  24.35 
 
 		 969 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  28.68 
 
 		 504 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  24.66 
 
 		 502 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 973 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  29.2 
 
 		 678 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  43.48 
 
 		 1136 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.14 
 
 		 996 aa  43.9  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  27.12 
 
 		 996 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  29.94 
 
 		 1030 aa  43.5  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>