More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0916 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
98 aa  202  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  76.77 
 
 
99 aa  154  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  76.77 
 
 
99 aa  154  5e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  75.76 
 
 
99 aa  153  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  74.75 
 
 
99 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  73.74 
 
 
99 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  73.74 
 
 
99 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  73.74 
 
 
99 aa  151  3e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  74.75 
 
 
99 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  74.75 
 
 
99 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  74.75 
 
 
99 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  74.75 
 
 
99 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  73.74 
 
 
99 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  72.73 
 
 
99 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  71.72 
 
 
99 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  74 
 
 
99 aa  146  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  67.35 
 
 
123 aa  144  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  67.35 
 
 
100 aa  141  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  69.07 
 
 
96 aa  139  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  62.89 
 
 
103 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  59.14 
 
 
104 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  56.57 
 
 
99 aa  118  2e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  55.67 
 
 
94 aa  119  2e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  55.21 
 
 
102 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52883e-05 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
98 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  55.56 
 
 
99 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  55 
 
 
104 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  55 
 
 
104 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 
99 aa  110  4e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  53.4 
 
 
104 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  54.74 
 
 
94 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  59.09 
 
 
88 aa  110  8e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 
97 aa  107  4e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  52.04 
 
 
99 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  52.53 
 
 
106 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  54.64 
 
 
268 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  58.54 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  51.16 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  44.44 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  51.16 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  51.16 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  49.38 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  53.06 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  47.37 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.66855e-11  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  48.28 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  48.28 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  49.47 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  55 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  47.67 
 
 
122 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  45.88 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  44.9 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  46.51 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
99 aa  82.8  1e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  45.83 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  44.19 
 
 
105 aa  80.1  9e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  45.98 
 
 
111 aa  80.1  1e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  40.91 
 
 
89 aa  79.7  1e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  40.91 
 
 
101 aa  80.1  1e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  44.33 
 
 
121 aa  79.3  2e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  1.03216e-06 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  41.18 
 
 
356 aa  78.6  2e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.19 
 
 
358 aa  77  8e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  44.44 
 
 
106 aa  76.6  9e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  39.58 
 
 
121 aa  75.9  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.68 
 
 
356 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.68 
 
 
356 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.68 
 
 
356 aa  75.9  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.68 
 
 
356 aa  75.5  2e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  52 
 
 
94 aa  75.5  3e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  40.62 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  42.86 
 
 
350 aa  74.7  4e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  40.82 
 
 
125 aa  73.9  6e-13  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  41.25 
 
 
200 aa  73.6  8e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  39 
 
 
108 aa  73.6  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  39.78 
 
 
93 aa  73.2  1e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.3 
 
 
352 aa  73.2  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  43.21 
 
 
193 aa  73.2  1e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
681 aa  72.4  2e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.51 
 
 
358 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  38.78 
 
 
122 aa  72.4  2e-12  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.57 
 
 
357 aa  72.8  2e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.51 
 
 
358 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6688  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.24 
 
 
341 aa  71.6  3e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.67 
 
 
351 aa  72  3e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45 
 
 
356 aa  71.6  3e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  51.43 
 
 
129 aa  71.2  5e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  44.87 
 
 
193 aa  70.9  5e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.67 
 
 
369 aa  70.9  6e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.51 
 
 
358 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  50 
 
 
129 aa  70.9  6e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.77 
 
 
358 aa  70.9  6e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  39.58 
 
 
124 aa  70.9  6e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.37 
 
 
358 aa  70.9  6e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.93 
 
 
368 aa  70.9  6e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.54 
 
 
348 aa  70.5  7e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  39.36 
 
 
108 aa  70.5  7e-12  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.98 
 
 
338 aa  70.5  8e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  43.42 
 
 
113 aa  70.1  8e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>