More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0880 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  35.3 
 
 		 1037 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  35.3 
 
 		 1037 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.86 
 
 		 1038 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  40.72 
 
 		 1046 aa  745    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1207  aminoglycoside/multidrug efflux system  35.3 
 
 		 1037 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.03 
 
 		 1024 aa  872    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  42.76 
 
 		 1031 aa  823    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0500  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.81 
 
 		 1051 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  36.82 
 
 		 1052 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  38.16 
 
 		 1037 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.99 
 
 		 1029 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  41.49 
 
 		 1022 aa  819    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  37.3 
 
 		 1051 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  37.71 
 
 		 1042 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.33 
 
 		 1031 aa  817    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.35 
 
 		 1046 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.16 
 
 		 1038 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  38.05 
 
 		 1046 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2643  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.73 
 
 		 1058 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1044 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0826  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.8 
 
 		 1045 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  40.52 
 
 		 1042 aa  791    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1037 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2599  aminoglycoside/multidrug efflux system  35.2 
 
 		 1037 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1040 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1357  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.86 
 
 		 1040 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000452964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.28 
 
 		 1057 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.23 
 
 		 1057 aa  874    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4054  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.48 
 
 		 1057 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.422503  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  37.45 
 
 		 1036 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.24 
 
 		 1059 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1035 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  35.58 
 
 		 1009 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1164  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.11 
 
 		 1040 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0522045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  40.98 
 
 		 1042 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1033 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  41.68 
 
 		 1038 aa  771    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  41.95 
 
 		 1048 aa  830    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  40.2 
 
 		 1036 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.05 
 
 		 1070 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 		 1028 aa  695    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  38.76 
 
 		 1045 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2369  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.01 
 
 		 1056 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.11897  normal  0.738324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.33 
 
 		 1057 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  42.95 
 
 		 1031 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0514  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.84 
 
 		 1069 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  38.98 
 
 		 1037 aa  726    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  40.73 
 
 		 1032 aa  737    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.95 
 
 		 1034 aa  800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 		 1047 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  41 
 
 		 1064 aa  738    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.94 
 
 		 1049 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.11 
 
 		 1047 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4788  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.37 
 
 		 1062 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  42.95 
 
 		 1031 aa  824    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.98 
 
 		 1037 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  39.83 
 
 		 1051 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  35.23 
 
 		 1069 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  35.16 
 
 		 1076 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  41.95 
 
 		 1031 aa  790    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  40.91 
 
 		 1034 aa  811    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.14 
 
 		 1062 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  36.46 
 
 		 1012 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  42.33 
 
 		 1031 aa  812    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.1 
 
 		 1066 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  41.45 
 
 		 1035 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.74 
 
 		 1019 aa  659    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.16 
 
 		 1063 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1256  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.56 
 
 		 1038 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.393229  normal  0.26342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.08 
 
 		 1059 aa  781    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.76 
 
 		 1043 aa  783    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 		 1047 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  42.7 
 
 		 1036 aa  786    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  42.53 
 
 		 1024 aa  787    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  36.69 
 
 		 1024 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.74 
 
 		 1019 aa  660    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1151  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.76 
 
 		 1043 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  36.79 
 
 		 1056 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  40.59 
 
 		 1026 aa  750    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  38.81 
 
 		 1030 aa  706    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  100 
 
 		 1068 aa  2149    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  38.14 
 
 		 1051 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  42.37 
 
 		 1031 aa  823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  38.54 
 
 		 1051 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  42.37 
 
 		 1031 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  42.33 
 
 		 1036 aa  798    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2616  aminoglycoside/multidrug efflux system  35.2 
 
 		 1037 aa  647    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.935344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  38.12 
 
 		 1034 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  40.94 
 
 		 1040 aa  729    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2749  aminoglycoside/multidrug efflux system  35.3 
 
 		 1037 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2900  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.97 
 
 		 1046 aa  710    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  38.65 
 
 		 1047 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  35.8 
 
 		 1045 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3270  multidrug efflux protein  35.21 
 
 		 1045 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  40.66 
 
 		 1031 aa  811    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.62 
 
 		 1055 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.67 
 
 		 1052 aa  720    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.91 
 
 		 1041 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  38.14 
 
 		 1051 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  42.37 
 
 		 1031 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>