More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0879 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
370 aa  772    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  66.21 
 
 
373 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  63.49 
 
 
373 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  56.95 
 
 
368 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  58.31 
 
 
374 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  54.18 
 
 
376 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  46.87 
 
 
376 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  36.14 
 
 
377 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  35.26 
 
 
375 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  32.7 
 
 
376 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  35.69 
 
 
377 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  32.43 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  33.78 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  34.76 
 
 
377 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  33.51 
 
 
377 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  34.06 
 
 
375 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  35.36 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  32.22 
 
 
387 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.67 
 
 
375 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 
378 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 
376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 
362 aa  132  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.06 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 
382 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 
384 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 
385 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
375 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 
362 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
368 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 
358 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.79 
 
 
384 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 
419 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 
424 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 
406 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 
358 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 
400 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 
387 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
403 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 
374 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 
434 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
390 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.62 
 
 
394 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 
394 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 
430 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 
390 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.32 
 
 
435 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 
413 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 
425 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.67 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 
400 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
391 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 
408 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
457 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  25.61 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.55 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  25.86 
 
 
425 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
440 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.65 
 
 
506 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  27 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.85 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  27.38 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>