More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0865 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  59.34 
 
 		 307 aa  342  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  53.2 
 
 		 305 aa  288  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  52.03 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  40.86 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.24 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.24 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.8 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.53 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40.79 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  44.04 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.55 
 
 		 302 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.78 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.78 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.78 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  41.78 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  41.78 
 
 		 314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.86 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  41.78 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  41.45 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.12 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.12 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.95 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.82 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  41.45 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  41.31 
 
 		 318 aa  211  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.82 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.82 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  39.4 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  41.2 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  40.27 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  41.33 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.97 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.27 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  38.44 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  38 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.87 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.66 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  36.18 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.04 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.7 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  40.53 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  41.81 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.67 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  39.6 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  38.26 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  38.38 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  38.38 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.7 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.28 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  38.38 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  38.33 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.93 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.79 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  36.19 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  36.79 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.49 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.49 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.49 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.49 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  38.49 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.33 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  38.23 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  42.31 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  39.3 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.16 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  39.59 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.32 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.47 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.83 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.87 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.82 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  40.68 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.33 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.76 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  36.15 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  42.03 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  39.86 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.25 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  40.46 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  37.42 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  44.55 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  37.78 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  39.72 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.56 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  38.05 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  39.52 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  39.14 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  36.52 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  36.52 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  36.7 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  35.79 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  38.01 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  37.12 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.14 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.67 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>