More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0859 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  66.13 
 
 
629 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  66.35 
 
 
641 aa  812    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  65.5 
 
 
639 aa  776    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  64.3 
 
 
628 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  65.12 
 
 
652 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
640 aa  1263    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  65.12 
 
 
652 aa  815    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  48.8 
 
 
593 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  35.91 
 
 
637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 
660 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
610 aa  303  9e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  35.88 
 
 
612 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  34.66 
 
 
597 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 
601 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 
602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.49 
 
 
599 aa  287  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  37.9 
 
 
601 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 
608 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  34.06 
 
 
598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
622 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  35.76 
 
 
601 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  38.12 
 
 
611 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  38.12 
 
 
611 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 
607 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 
602 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 
611 aa  276  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
760 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 
619 aa  275  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 
637 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.22 
 
 
399 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.64 
 
 
399 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  36.99 
 
 
620 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  31.06 
 
 
625 aa  268  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  32.64 
 
 
651 aa  264  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  36.61 
 
 
741 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.77 
 
 
763 aa  262  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 
764 aa  260  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 
569 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 
616 aa  259  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
617 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.64 
 
 
401 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.65 
 
 
669 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
670 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
673 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 
670 aa  250  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.38 
 
 
401 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 
617 aa  247  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 
596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.87 
 
 
596 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.87 
 
 
596 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 
596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.14 
 
 
666 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  35.02 
 
 
616 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.85 
 
 
596 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 
660 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  31.55 
 
 
596 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 
660 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 
660 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
604 aa  242  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  38.59 
 
 
719 aa  242  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 
660 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 
596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  30.16 
 
 
606 aa  241  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  41.77 
 
 
421 aa  240  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
625 aa  239  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 
643 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  35.91 
 
 
599 aa  234  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  44.56 
 
 
414 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
852 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.78 
 
 
626 aa  224  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  34.87 
 
 
584 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  30 
 
 
617 aa  220  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 
702 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.77 
 
 
414 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
607 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 
623 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  41.77 
 
 
414 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  40.46 
 
 
402 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.95 
 
 
628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.03 
 
 
630 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  43.22 
 
 
421 aa  207  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
609 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.44 
 
 
595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  29.18 
 
 
640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 
407 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.04 
 
 
597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 
431 aa  122  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 
598 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  28.54 
 
 
626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.21 
 
 
596 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.27 
 
 
498 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.35 
 
 
598 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.56 
 
 
597 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 
414 aa  101  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  29.34 
 
 
500 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
608 aa  99.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  25.05 
 
 
506 aa  98.6  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
531 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
574 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 
478 aa  98.2  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>