209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0657 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  64.29 
 
 
1012 aa  1046    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  89.5 
 
 
1118 aa  1901    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 
1113 aa  2203    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  81.43 
 
 
1340 aa  1546    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  84.27 
 
 
889 aa  1408    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  71.48 
 
 
2194 aa  754    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.05 
 
 
1009 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  83.45 
 
 
1222 aa  1582    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  82.79 
 
 
1225 aa  1567    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.19 
 
 
891 aa  597  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  56.7 
 
 
1019 aa  344  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.47 
 
 
1800 aa  280  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  45.58 
 
 
1838 aa  271  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.22 
 
 
1661 aa  241  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  41.98 
 
 
1037 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  40.37 
 
 
2807 aa  230  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.64 
 
 
1269 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.42 
 
 
1269 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  42.02 
 
 
828 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  35.43 
 
 
1557 aa  209  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  42.32 
 
 
386 aa  209  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.98 
 
 
928 aa  198  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  41.05 
 
 
412 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  29.95 
 
 
1029 aa  195  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.73 
 
 
1029 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  40.84 
 
 
872 aa  187  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  42.94 
 
 
1490 aa  180  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  41.63 
 
 
2305 aa  172  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  38.52 
 
 
974 aa  172  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.92 
 
 
813 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  42.33 
 
 
1126 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.05 
 
 
4379 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  36.71 
 
 
644 aa  165  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.74 
 
 
2310 aa  165  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  34.66 
 
 
554 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.39 
 
 
1289 aa  162  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.23 
 
 
3396 aa  158  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.48 
 
 
5899 aa  157  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  40.06 
 
 
604 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  36.22 
 
 
1275 aa  155  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.07 
 
 
768 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  38.11 
 
 
662 aa  144  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  34.81 
 
 
616 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.28 
 
 
1415 aa  126  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  31.52 
 
 
472 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  35.17 
 
 
469 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  33.43 
 
 
685 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.08 
 
 
1180 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.25 
 
 
4013 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  37.28 
 
 
663 aa  97.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  24.77 
 
 
2127 aa  94.7  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  35.38 
 
 
657 aa  92.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  32.28 
 
 
494 aa  91.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  36.69 
 
 
5444 aa  91.3  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.65 
 
 
3197 aa  91.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.87 
 
 
7149 aa  89.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.94 
 
 
3197 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  47.79 
 
 
161 aa  85.9  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.47 
 
 
1124 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  29.27 
 
 
1058 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  31.63 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.48 
 
 
3168 aa  81.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.71 
 
 
647 aa  80.9  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.1 
 
 
8871 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  31.56 
 
 
510 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  34.91 
 
 
837 aa  78.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  33.96 
 
 
894 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  39.81 
 
 
2334 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  37.74 
 
 
894 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.89 
 
 
255 aa  74.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  33.13 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  36.26 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  38.46 
 
 
2632 aa  71.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  38.32 
 
 
863 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  28.57 
 
 
2251 aa  70.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.4 
 
 
1594 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.48 
 
 
4848 aa  69.3  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.83 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.87 
 
 
1021 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  30.61 
 
 
1527 aa  68.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.04 
 
 
600 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  25.3 
 
 
2042 aa  67  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.27 
 
 
2796 aa  67  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.33 
 
 
959 aa  67  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  28.83 
 
 
917 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.14 
 
 
5098 aa  65.1  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  32.76 
 
 
1022 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.13 
 
 
615 aa  64.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.24 
 
 
1246 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.7 
 
 
690 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.09 
 
 
1091 aa  64.3  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  25.33 
 
 
456 aa  63.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  30.97 
 
 
1053 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  29.44 
 
 
715 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  45.95 
 
 
934 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.27 
 
 
1192 aa  62.4  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.41 
 
 
11716 aa  62.4  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.97 
 
 
365 aa  62.4  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
1127 aa  62  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  29.61 
 
 
663 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>