27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0639 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  100 
 
 
315 aa  630  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  44.03 
 
 
471 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  39.54 
 
 
462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  37.34 
 
 
462 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  38.03 
 
 
460 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  37.93 
 
 
464 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  38.73 
 
 
477 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.85 
 
 
1221 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  34.29 
 
 
1213 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
1193 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 
438 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
464 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.66 
 
 
1188 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  34.08 
 
 
1209 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.92 
 
 
1196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  32.35 
 
 
1208 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  33.66 
 
 
566 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.41 
 
 
1190 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28 
 
 
1411 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  30.25 
 
 
513 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  31.08 
 
 
492 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.51 
 
 
1247 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.05 
 
 
1188 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  28.33 
 
 
396 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  54.35 
 
 
111 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  25.51 
 
 
760 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.83 
 
 
1454 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>