More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0623 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  100 
 
 		 360 aa  730    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  34.35 
 
 		 567 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  50.26 
 
 		 710 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  47.92 
 
 		 500 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  41.89 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  47.67 
 
 		 506 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 		 508 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.18 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 515 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.93 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  25.46 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.54 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  26.92 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.74 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.77 
 
 		 468 aa  97.4  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  23.92 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  23.92 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  24.17 
 
 		 379 aa  95.9  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.48 
 
 		 439 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.74 
 
 		 441 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  28.95 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.27 
 
 		 453 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.38 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  32.09 
 
 		 449 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  34.23 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.9 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.9 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  34.23 
 
 		 484 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.9 
 
 		 460 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.65 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.41 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  25.88 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  23.43 
 
 		 627 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.66 
 
 		 458 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  24.73 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.57 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  31.09 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  27.92 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  23.68 
 
 		 441 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  29.76 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.32 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.84 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.97 
 
 		 518 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.76 
 
 		 460 aa  87  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.34 
 
 		 460 aa  87  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.27 
 
 		 465 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.03 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.27 
 
 		 465 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.95 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.85 
 
 		 404 aa  86.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.52 
 
 		 453 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.56 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.56 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.56 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.56 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  31.52 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  23.58 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  32.93 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.15 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.31 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  23.93 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.92 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.05 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.64 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.56 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.52 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.73 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  29.66 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.84 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  38.74 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.87 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.41 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  24.14 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.26 
 
 		 460 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.27 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.62 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  31.47 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.61 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.51 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.13 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.61 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.61 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  23.29 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.79 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.03 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.97 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.71 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.36 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.28 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.9 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  25.45 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.07 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.24 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.81 
 
 		 447 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>