More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0607 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
957 aa  1933    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  34.69 
 
 
1009 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  35.93 
 
 
809 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
1060 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 
991 aa  301  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.39 
 
 
828 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  34.33 
 
 
782 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
949 aa  230  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  29.68 
 
 
985 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
1313 aa  225  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.49 
 
 
1328 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 
854 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
868 aa  181  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.06 
 
 
853 aa  177  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
851 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.55 
 
 
1238 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.48 
 
 
1266 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  24.65 
 
 
891 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.42 
 
 
3299 aa  170  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.69 
 
 
2145 aa  169  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  23.15 
 
 
950 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.69 
 
 
3537 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
883 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  26.99 
 
 
950 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  25.81 
 
 
941 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.65 
 
 
3535 aa  161  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.65 
 
 
3419 aa  161  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
1101 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.65 
 
 
3298 aa  158  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  46.24 
 
 
192 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
905 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
1526 aa  151  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.64 
 
 
944 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
905 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 
904 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 
1186 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
1261 aa  147  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.15 
 
 
725 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  29.51 
 
 
447 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.51 
 
 
1914 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.04 
 
 
1550 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.07 
 
 
960 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
1450 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.97 
 
 
1650 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
1162 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 
2741 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
1714 aa  138  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 
1162 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
2741 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.37 
 
 
1772 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.07 
 
 
755 aa  131  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.42 
 
 
840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  29.43 
 
 
340 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
1063 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  28.62 
 
 
845 aa  128  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
796 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
822 aa  127  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 
636 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
454 aa  124  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
438 aa  122  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
1288 aa  122  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.69 
 
 
553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.91 
 
 
694 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.57 
 
 
418 aa  119  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.61 
 
 
1040 aa  118  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.33 
 
 
825 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 
767 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 
1424 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
1025 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.84 
 
 
1404 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1215 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.67 
 
 
740 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.36 
 
 
1180 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 
771 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 
854 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.64 
 
 
1279 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
760 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  24.24 
 
 
698 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
924 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 
1507 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
568 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 
568 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.92 
 
 
609 aa  108  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
916 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
1596 aa  105  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
751 aa  104  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.11 
 
 
836 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
878 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24.75 
 
 
1044 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
923 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
659 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
787 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.17 
 
 
1147 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.03 
 
 
2637 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  24.06 
 
 
1048 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  22.96 
 
 
708 aa  98.6  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>