42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0493 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  297  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  68.91 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  68.07 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  66.96 
 
 		 134 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  60.5 
 
 		 145 aa  154  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  53.39 
 
 		 140 aa  127  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  52.59 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  52.21 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  51.69 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  50.88 
 
 		 137 aa  120  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  49.17 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  49.17 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  46.22 
 
 		 134 aa  110  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  46.15 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  49.11 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  42.06 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  44.26 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  47.32 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  46.43 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  46.85 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  44.92 
 
 		 122 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  46.43 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  47.32 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  47.32 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  45.54 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  42.62 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  41.88 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  42.62 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  38.84 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  40.95 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  42.98 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  42.5 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  42.5 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  39.81 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  39.81 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  40.74 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  42.5 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  36.7 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  36.7 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3509  OmpA/MotB domain protein  33.82 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>