More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0482 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  61.78 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  60.22 
 
 		 221 aa  230  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  62.7 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  62.7 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0043  Ribonuclease H  58.38 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.618415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  54.79 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  54.95 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  51.67 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.37 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  51.56 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 256 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  51.56 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  50.78 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  55.14 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  48.42 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.97 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 199 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 240 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.2 
 
 		 277 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  47.96 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.73 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 250 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  51.08 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  51.31 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  50 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0314  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  51.32 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  43.96 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  50.27 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  50.26 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  50.81 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23711  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.108484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  46.24 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 268 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  46.86 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.39 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.81 
 
 		 256 aa  154  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  49.46 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  46.88 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1353  Ribonuclease H  51.37 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  48.39 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  47.4 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  50.8 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 214 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  46.88 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>