53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0407 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 308 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87686  predicted protein  31.91 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.12 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.29 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.47 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.95 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.95 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.88 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.11 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.74 
 
 		 189 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  28.48 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  25.9 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  28.76 
 
 		 180 aa  53.1  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  25.9 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  29.68 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  26.9 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.75 
 
 		 183 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.25 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.87 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  26.03 
 
 		 153 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  33.56 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  27.85 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  26.62 
 
 		 200 aa  49.3  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  30.91 
 
 		 214 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.87 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  27.56 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  29.75 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  29.5 
 
 		 212 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  23.94 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  28.48 
 
 		 183 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  26.71 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  26.21 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  24.18 
 
 		 162 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.92 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  31.58 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  24.11 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  25.52 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.46 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.27 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  26.53 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  24.83 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.76 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  28.08 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  28.08 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  24.36 
 
 		 175 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  24.39 
 
 		 192 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  23.87 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  26.29 
 
 		 171 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.76 
 
 		 175 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.08 
 
 		 174 aa  42.7  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  29.03 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>