248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0332 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  100 
 
 
409 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1353  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  67.87 
 
 
459 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2823  Na+ dependent nucleoside transporter  62.59 
 
 
402 aa  522  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  50.8 
 
 
440 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  49.27 
 
 
408 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  50 
 
 
408 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  46.79 
 
 
412 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04679  nucleoside transporter  47.62 
 
 
432 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2998  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.05 
 
 
413 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0642  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  46.79 
 
 
432 aa  345  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.699261  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4039  Na+ dependent nucleoside transporter  46.01 
 
 
443 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.283567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3056  Na+ dependent nucleoside transporter  45.41 
 
 
418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  41.19 
 
 
420 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  42.21 
 
 
419 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  41.43 
 
 
417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  43.34 
 
 
406 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  43.17 
 
 
419 aa  328  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  41.55 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  42.44 
 
 
402 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  42.34 
 
 
420 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  42.62 
 
 
418 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  41.9 
 
 
422 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  41.88 
 
 
427 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  41.97 
 
 
419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  41.87 
 
 
420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  42.45 
 
 
419 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  42.45 
 
 
419 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  42.21 
 
 
419 aa  319  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  42.21 
 
 
419 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  41.41 
 
 
427 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  42.34 
 
 
419 aa  317  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  41.49 
 
 
419 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  41.43 
 
 
422 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  42.45 
 
 
419 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  42.45 
 
 
419 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4717  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.42 
 
 
420 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210913  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  42.32 
 
 
425 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  42.33 
 
 
432 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  41.71 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  41.63 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  42.72 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  41.63 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  41.93 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  40.34 
 
 
402 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  42.21 
 
 
419 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  42.43 
 
 
404 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  41.9 
 
 
422 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13293  nucleoside transporter  42.5 
 
 
585 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.752167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  40.99 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  41.71 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  41.67 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  42.86 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  41.06 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  40.89 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  41.67 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  43.85 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  39.72 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  41.67 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  39.95 
 
 
425 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1193  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.12 
 
 
475 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  41.75 
 
 
414 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  41.63 
 
 
399 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  42.16 
 
 
405 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  39.27 
 
 
402 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05493  nucleoside transporter (Eurofung)  39.76 
 
 
614 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128768  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  40.62 
 
 
414 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  40 
 
 
402 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  39.9 
 
 
402 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  39.9 
 
 
402 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  40.24 
 
 
408 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  37.91 
 
 
413 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  39.9 
 
 
402 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  39.9 
 
 
402 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  41.77 
 
 
403 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  41.77 
 
 
403 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  41.77 
 
 
403 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  41.77 
 
 
403 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  41.77 
 
 
403 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  41.77 
 
 
403 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  41.28 
 
 
403 aa  289  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  39.41 
 
 
401 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  40.59 
 
 
420 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  40.24 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  40.38 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  40.38 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2117  Na+ dependent nucleoside transporter  39.15 
 
 
413 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000427542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  38.59 
 
 
418 aa  280  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  38.41 
 
 
425 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  34.71 
 
 
406 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  38.04 
 
 
425 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  38.15 
 
 
419 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77434  concentrative Na+-nucleoside cotransporte  37.2 
 
 
594 aa  273  5.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.443393 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  36.58 
 
 
424 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  36.58 
 
 
424 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  36.58 
 
 
424 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  36.1 
 
 
426 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  36.58 
 
 
424 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  36.1 
 
 
416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  36.1 
 
 
416 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  36.6 
 
 
566 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>