More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0185 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  100 
 
 		 392 aa  810    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  56.49 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  57.77 
 
 		 401 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  54.78 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  57.14 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  54.52 
 
 		 395 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  45.95 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  41.73 
 
 		 428 aa  316  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  42.15 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  40.2 
 
 		 400 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  42.01 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  41.9 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  39.95 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  37.76 
 
 		 391 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  37.69 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  38.72 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  37.76 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  32.21 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  32.72 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  29.06 
 
 		 372 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.13 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  30.29 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  30.55 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  26.92 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  26.42 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  25.75 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  27.49 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  24.63 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.18 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.57 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  27.39 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  26.84 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.87 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.02 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.06 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.12 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  25.38 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  28.7 
 
 		 380 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  25.77 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.04 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  24.73 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  24.49 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  26.37 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.69 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  30.06 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  27.72 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  31.98 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.56 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  25.25 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.44 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  31.7 
 
 		 469 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  25.54 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  24.94 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 605 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  27.56 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  30.17 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.12 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  27.18 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  25.65 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  28.12 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  25.65 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.67 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  26.71 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.42 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.89 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  24.47 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.19 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  25.44 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.65 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  25.31 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.92 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.94 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.37 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  25.45 
 
 		 495 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  27.25 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.33 
 
 		 650 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  25.62 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.61 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  27.25 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.69 
 
 		 880 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  24.74 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.91 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  25.97 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.08 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.96 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.54 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.83 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.36 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.83 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.48 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.67 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  26.97 
 
 		 688 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.02 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.15 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 666 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.42 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.38 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>