More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0161 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  61.51 
 
 		 284 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  63.04 
 
 		 281 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  61.42 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  62.65 
 
 		 281 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  61.07 
 
 		 292 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  58.14 
 
 		 295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  56.03 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  44.09 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  44.22 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  41.83 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  44.57 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  44.57 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  44.35 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  40.67 
 
 		 295 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  44.32 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  43.72 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  39.92 
 
 		 270 aa  204  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  41.15 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  41.44 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  36.92 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  39.38 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  41.11 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  39.77 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  37.74 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  42.18 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  41.38 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  40.53 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  42.17 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  40.07 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  43.56 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  40.48 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  40.8 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  38.26 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  39.31 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  39.39 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  37.4 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  41.22 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  36.36 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  38.59 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  40.15 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  41.76 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  40.4 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  37.01 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  41.42 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  39.84 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  39.78 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  36.4 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  40.3 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  40.18 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  40.18 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  36.23 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  41.2 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.17 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  40.16 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  40.68 
 
 		 274 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  39.73 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  38.49 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  37.87 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  40.6 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  38.01 
 
 		 285 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  35.74 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  37.17 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  39.47 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  36.43 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  39.2 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  38.15 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  36.8 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  38.89 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  38.89 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  39.2 
 
 		 270 aa  175  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  36.43 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  36.43 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  38.89 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  36.43 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  36.05 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  41.41 
 
 		 307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  35.41 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  38.43 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  34.98 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  39 
 
 		 360 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.58 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  38.71 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  36.54 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  38.4 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  35.83 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  35.36 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  38.29 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  36.61 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  38.1 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  33.33 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  38.06 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  34.34 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>