135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0142 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  100 
 
 
351 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  61.34 
 
 
352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  61.05 
 
 
352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  62.61 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  61.65 
 
 
352 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  62.86 
 
 
350 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  42.24 
 
 
376 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.12 
 
 
360 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.83 
 
 
359 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  29.18 
 
 
374 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  29.18 
 
 
374 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  40 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.83 
 
 
357 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  28.61 
 
 
359 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  32.45 
 
 
376 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  29.25 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  28.98 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  29.04 
 
 
454 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  27.52 
 
 
393 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  28.21 
 
 
424 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  28.21 
 
 
313 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  28.21 
 
 
410 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  28.21 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  28.21 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  28.21 
 
 
426 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  28.21 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  24.86 
 
 
387 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  27.68 
 
 
380 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  22.56 
 
 
435 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  26.1 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  22.31 
 
 
418 aa  89.4  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  25.6 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  24.87 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  24.85 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.27 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  24 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  26.44 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  25 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  23.1 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  26.06 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  23.92 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  23.92 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.12 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  23.67 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  23.76 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  23.76 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  23.76 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.57 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  24.35 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  23.21 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  23.22 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  23.03 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  22.61 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  23.81 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.8 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  23.08 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  24.67 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  24.15 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  23.31 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  24.61 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  24.29 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  23.4 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  23.47 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  24.17 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  25.57 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  24.41 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  25.82 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.67 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.49 
 
 
325 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  24.4 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  25.89 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  25.32 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  23.97 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  27.66 
 
 
405 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  22.92 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  22.48 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  23.89 
 
 
370 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  22.46 
 
 
366 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  23.89 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  22.64 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  21.17 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  26.67 
 
 
180 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  22.22 
 
 
360 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.36 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  22.54 
 
 
353 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.31 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.31 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  22.31 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.31 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.31 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  25.36 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  24.48 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  22.31 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  23.3 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>