14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0131 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0131  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818485  decreased coverage  0.00619864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0960  protein of unknown function DUF820  54.84 
 
 
226 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.457496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  52.69 
 
 
223 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0879  protein of unknown function DUF820  55.91 
 
 
222 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222947  hitchhiker  0.0000240663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1869  protein of unknown function DUF820  54.84 
 
 
226 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1895  protein of unknown function DUF820  54.84 
 
 
226 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0867357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  48.94 
 
 
233 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  47.87 
 
 
241 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  44.68 
 
 
237 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  47.87 
 
 
244 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  46.81 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1997  hypothetical protein  47.31 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.611107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1713  hypothetical protein  43.01 
 
 
223 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1679  hypothetical protein  54.55 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>