19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0054 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0054  signal transduction protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  28.29 
 
 		 801 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.57 
 
 		 649 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.27 
 
 		 911 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  26.92 
 
 		 1051 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.9 
 
 		 825 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  36.05 
 
 		 2303 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  31.78 
 
 		 766 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 2262 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.91 
 
 		 1041 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  34.65 
 
 		 872 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  25.17 
 
 		 844 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.68 
 
 		 762 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.68 
 
 		 762 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  25.98 
 
 		 447 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  25.86 
 
 		 670 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 2262 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  31.63 
 
 		 725 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  23.7 
 
 		 402 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>