17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0042 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0042    100 
 
 
443 bp  878    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3097  hypothetical protein  96.4 
 
 
240 bp  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1527  hypothetical protein  96.4 
 
 
231 bp  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1375  hypothetical protein  96.4 
 
 
231 bp  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    92.71 
 
 
302 bp  135  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    92.55 
 
 
486 bp  131  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    90.91 
 
 
291 bp  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    90.43 
 
 
635 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    90.43 
 
 
589 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  88.54 
 
 
201 bp  103  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    88.3 
 
 
455 bp  99.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4643  ISSru3, transposase InsB  86.36 
 
 
231 bp  99.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104155  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4875    86.36 
 
 
231 bp  99.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    92 
 
 
234 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  88.33 
 
 
99 bp  63.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  84.71 
 
 
201 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    87.5 
 
 
351 bp  48.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>