20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0036 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0036    100 
 
 
216 bp  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  95.37 
 
 
234 bp  349  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  96.3 
 
 
210 bp  319  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    90.83 
 
 
399 bp  268  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    91.39 
 
 
773 bp  264  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  89.64 
 
 
294 bp  224  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    89.64 
 
 
294 bp  224  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  88.08 
 
 
297 bp  200  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  89.7 
 
 
186 bp  192  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  90.41 
 
 
153 bp  178  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3947  hypothetical protein  90.51 
 
 
150 bp  168  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.936917  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  93.64 
 
 
147 bp  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    89.04 
 
 
327 bp  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  85.19 
 
 
210 bp  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    89.47 
 
 
729 bp  145  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  94.81 
 
 
165 bp  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  89.36 
 
 
114 bp  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  92.21 
 
 
120 bp  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0123    83.16 
 
 
192 bp  61.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19105  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1330  transposase  87.76 
 
 
327 bp  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.735246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>