77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0018 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  100 
 
 		 731 aa  1446    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  56.95 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  56.64 
 
 		 416 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  56.33 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  54.22 
 
 		 413 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  51.5 
 
 		 452 aa  350  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  48.09 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  48.09 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  39.43 
 
 		 617 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  31.56 
 
 		 365 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  30.67 
 
 		 357 aa  136  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  31.7 
 
 		 360 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  33.81 
 
 		 363 aa  132  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  32.11 
 
 		 360 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  31.8 
 
 		 366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0359  hypothetical protein  66.96 
 
 		 194 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0572296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  38.62 
 
 		 1068 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  32.21 
 
 		 366 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  36.09 
 
 		 827 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  31.94 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  38.9 
 
 		 1186 aa  118  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  40.06 
 
 		 1012 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  48.09 
 
 		 361 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  44.55 
 
 		 1035 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  39.73 
 
 		 962 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  35.82 
 
 		 903 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1241  hypothetical protein  66.32 
 
 		 178 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0655211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1386  hypothetical protein  68.18 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  34.56 
 
 		 737 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1076  hypothetical protein  63.64 
 
 		 166 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.67569  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  29.55 
 
 		 261 aa  87.8  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  38.89 
 
 		 862 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  30.14 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  31.91 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  34.33 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1232  hypothetical protein  70.97 
 
 		 99 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  27.14 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  33.81 
 
 		 244 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0791  hypothetical protein  65.15 
 
 		 96 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  31.03 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  21.62 
 
 		 763 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  32.82 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  27.04 
 
 		 273 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  21.97 
 
 		 748 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  28.68 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  35.44 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3197  hypothetical protein  21.71 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  25.21 
 
 		 256 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1191 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  34.38 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1114  hypothetical protein  29.53 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0990251  normal  0.0233772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1134  hypothetical protein  31.08 
 
 		 466 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00871122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  22.73 
 
 		 644 aa  50.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  21.82 
 
 		 782 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  30.77 
 
 		 1111 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  21.82 
 
 		 782 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1203  hypothetical protein  30.41 
 
 		 466 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1075  hypothetical protein  29.05 
 
 		 447 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  28.49 
 
 		 2095 aa  44.3  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>