42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0014 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0014  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  268  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.51836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4269  hypothetical protein  67.48 
 
 
128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.237355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2291  hypothetical protein  64.46 
 
 
125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3601  hypothetical protein  61.6 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2513  hypothetical protein  61.6 
 
 
132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1222  hypothetical protein  61.29 
 
 
125 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2085  hypothetical protein  59.5 
 
 
129 aa  157  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00513635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1258  hypothetical protein  49.17 
 
 
137 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4834  hypothetical protein  39.06 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4691  hypothetical protein  38.28 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1403  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0531  hypothetical protein  34.92 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_10591  predicted protein  26.26 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120478  normal  0.660881 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  31.45 
 
 
363 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49656  predicted protein  29.6 
 
 
399 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  30.43 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  31.68 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  27.66 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  29.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  24.49 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6103  hypothetical protein  27.66 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0493798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  29.7 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  25.27 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  27.55 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  29.13 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  25.89 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31684  predicted protein  23.81 
 
 
231 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  23.21 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  22.88 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  30.21 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  27.88 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  25.64 
 
 
149 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  25.86 
 
 
160 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  25.71 
 
 
140 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  23.21 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  25.71 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  22.03 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  20.83 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  26.92 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  23.02 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>